Jan 22, 2018 · 它需要依赖比对软件（例如mafft、clustalw等）、Epal2nal.pl脚本（ParaAT安装包自带）以及KaKs_Calculator软件，因此在安装ParaAT软件的同时，也要把这些依赖的软件安装好，并 …

ka/ks=1 那么是中性选择，大于1则是正向选择，小于1则是负向选择。这是为什么呢？自然选择不是只影响突变…

Nov 13, 2025 · 一、概述 本教程分享一个R脚本，可以用于绘制多物种的RSCU分析中的密码子偏好柱形图。只需要用户导入蛋白编码基因序列即可生成多个分析结果文件，其中包括RSCU数值及可视化图 …

1.2进行序列比对 软件安装： ParaAT2 KaKs_Calculator2 可以进行批量提交任务，对于每个任务来说所有的文件都在同一个文件夹内。每个文件夹下包含以下内容 geneList.txt 同源基因列表文件 …

Oct 30, 2023 · 一、基本分析内容 数据库检索 进化树构建 保守domain和motif分析. 基因结构分析. 转录组或荧光定量表达分析. 二、具体分析流程 1、数据库检索 如何获得其他物种已发表某个基因家族的所 …

一、概述 本教程分享如何使用Geneious进行有参考基因组的线粒体基因组组装。组装用到二代或三代的全基因组测序数据，通过与近缘物种参考基因组的比对，得到完整的环状的线粒体基因组序列。 二 …

Coinfinder：检测全基因组中的重要连锁和互斥 Coinfinder 用于评估全基因组中的同源基因集（基因家族）的连锁（共同存在）或者互斥（不共存）事件是否比偶然预期的更频繁。Coinfinder 使用用户提供 …

这个图片中的b图就是参与甾体皂苷生物合成的基因kaks选择压力图的一个绘制（我们一般可以绘制一个基因家族不同物种间或者物种内的进化速率分析）

知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区 …

Oct 12, 2020 · 使用KaKs_Calculator2.0计算KaKs的一个简单小例子 发布于 2020-10-12 06:57 ・ 2015 次播放 欢迎参与讨论 默认